Una ONG liderada por los abogados macristas Yamil Santoro y José Magioncalda, llamada Fundación Apolo, impugnó la postulación de Daniel Rafecas para Procurador General de la Nación. A poco menos de una semana de que Alberto Fernández oficializara la propuesta, la fundación presentó la impugnación ante el Ministerio de Justicia cuestionando la "idoneidad moral" de Rafecas. Una de las principales críticas estuvo dirigida contra su actuación frente a la denuncia hecha en el 2015 por Alberto Nisman contra el Memorándum de Entendimiento con Irán, recriminándole que la hubiera desestimado "en tiempo récord". Otro de los cuestionamientos estuvo dirigido hacia su desempeño en la "causa Ciccone" que involucró al ex vicepresidente Amado Boudou.